Από το 1996 το Εργαστήριο Πληροφορικής υποστηρίζει το έργο των μεταπτυχιακών προγραμμάτων του Τομέα Μαθηματικών και Πληροφορικής που έχουν σχέση με τις ΤΠΕ στην Εκπαίδευση. Eπίσης, το Εργαστήριο υποστηρίζει το έργο των μεταπτυχιακών προγραμμάτων άλλων κατευθύνσεων του Παιδαγωγικού Τμήματος Δημοτικής Εκπαίδευσης.

Ειδικότερα, το Εργαστήριο Πληροφορικής υποστηρίζει με τις υποδομές τις διδακτικές και εργαστηριακές ανάγκες μαθημάτων των ακόλουθων μεταπτυχιακών προγραμμάτων:

• Τεχνολογίες της Πληροφορίας και Επικοινωνίας (ΤΠΕ) στην Πρωτοβάθμια Εκπαίδευση
• Κοινό Διιδρυματικό ΠΜΣ «Εκπαιδευτικός Σχεδιασμός Διαδικτυακής (Online) Εκπαίδευσης (ΠΤΔΕ ΕΚΠΑ & Αιγαίου
• Εκπαίδευση STEM και Συστήματα Εκπαιδευτικών Ρομποτικών Διατάξεων
• Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Π.Τ.Δ.Ε., Ιατρική Σχολή, Τμήμα Βιολογίας) «Κοινωνική Νευροεπιστήμη, Κοινωνική Παιδαγωγική Και Εκπαίδευση»